Mikroorganismers diversitet og anvendelse

• Give et overblik over mikroorganismernes evolutionære diversitet.
• Give et overblik over mikrobiel fysiologisk diversitet.
• Redegøre for problemerne, der knytter sig til klassifikation og artsbegreb hos mikroorganismer.
• Designe forsøg og redegøre for metoder til at identificere mikroorganismer.
• Redegøre for mikrobielle interaktioner, herunder de molekylære mekanismer, som ligger til grund for dem.
• Redegøre for basal mikrobiel økologi – herunder teknikker til at studere mikroorganismer in situ.
• Beskrive kommercielt vigtige mikroorganismer samt de processer, de indgår i.
• Vurdere konventioner, der regulerer kommerciel udnyttelse af mikroorganismer.
• Beskrive forskellige screeningsmetoder for bioteknologisk og innovationsmæssigt relevante mikroorganismer.
• Beskrive hvordan mikroorganismer med interessante egenskaber kan isoleres fra naturlige miljøprøver.

Overordnet gennemgang af den mikrobielle diversitet, som foregår ved at belyse de fylogenetiske, taxonomiske og fysiologiske ligheder og forskelle mellem bakterier, archaea og eukaryoter – med fokus på de bioteknologisk og medicinsk interessante mikroorganismer. Følgende områder vil herunder blive behandlet:
• Artsbegrebet. Evolutionært betinget klassifikation. Beskrivelse af nye arter. Fylogeni vs. klassisk taxonomi.
• Vigtige grupper af mikroorganismer og deres metabolisme.
• Gennemgang af biodiversitet fra individ til økosystem. Mikrobiel økologi.
• Isolering og identifikation af mikroorganismer og screening for ønskede egenskaber.
• Mikroorganismers ernæringsmæssige krav. Design af isoleringsmedier. Biokonsortier, habitater, inkuberingsbetingelser, stammesamlinger.
• Bioteknologisk udnyttelse af mikrobiel biodiversitet.

27022/27026/27027/27028, Eller tilsvarende

Forelæsninger og gruppearbejde