Enkeltfag Engelsk 5 ECTS

Computational Precision medicine

Overordnede kursusmål

The overordnet mål med dette kursus er at gøre de studerende i stand til at anvende datalogiske værktøjer indenfor præcisionsmedicin. I kurset lægges der særligt fokus på emner indenfor præcisionsdiagnostik såsom patientstratificering ud fra genekspressionsprofilering, og præcisionsbehandling, herunder særligt identifikation og evaluering af targets til cancer immunterapi.

See course description in English

Læringsmål

  • Forklare koncepterne bag anvendt præcisionsmedicin i klinikken
  • Forklare koncepterne bag behandlingsstratificering af cancerpatienter
  • Forklare koncepterne bag cancer immunterapi
  • Anvende grundlæggende metoder til usuperviseret clustering baseret på genekspression
  • Anvende grundlæggende metoder til klassifikation af prøver baseret på genekspression
  • Anvende differentiel genekspressionsanalyse til at finde potentielle tumorassocierede antigener
  • Anvende isoform switch analyse til at finde potentielle cellemembranantigener
  • Analysere brugen af bioinformatik i præcisionsmedicin i forhold til anvendelsen i klinikken

Kursusindhold

I dette kursus vil de studerende blive introduceret til bioinformatiske metoder indenfor præcisionsmedicin. De studerende vil lære, hvordan transcriptomics data fra microarrays eller RNA sekventering kan bruges til diagnostik og patientstratificering, når optimale behandlingsformer skal vælges. De studerende vil også lære princripperne i præcisions- og personlig behandling ved analyse af RNA og DNA sekventeringsdata.

Hver forelæsning består af en introduktion til et klinisk problem af en domæneekspert fra translationel forskning og/eller en kliniker, efterfulgt af en introduktion til hvordan problemet kan løses bioinformatisk, efterfulgt af praktiske øvelser. De to sidstnævnte vil foregår i programmeringssproget R.

Evalueringen er baseret på et hands- on gruppeprojekt, hvori et præcisionsmedicinsk problem skal løses. De studerende kan enten vælge et prædefineret projekt eller finde på deres eget. Eksamineringen foregår ved, at projektet bliver præsenteret i grupper efterfulgt af individuelle mundtlige eksaminationer i hele pensum.

Anbefalede forudsætninger

02402/22110/22100/22126/27002/27008, Kurset antager, at den studerende har erfaring med programmering i R, da alle øvelser og gruppearbejde vil foregå i dette programmeringssprog. En grundlæggende forståelse for next generation sequencing og god forståelse for statistik er stærkt anbefalet.

Undervisningsform

Forelæsninger, computerøvelser og gruppearbejde

Fakultet

Pladsbegrænsning

Minimum 10, Maksimum: 40.

Vær opmærksom på, at dette enkeltfagskursus har et minimumskrav til antal deltagere. Derudover er der begrænsning på antallet af studiepladser. Er der for få tilmeldinger oprettes kurset ikke. Er der for mange tilmeldinger, vil der blive trukket lod om pladserne. Du får besked om, om du har fået tildelt en studieplads senest 8 dage før kursusstart.

Se kurset i kursusbasen

Tilmelding

Sprog

Engelsk

Varighed

3 uger

Institut

Sundhedsteknologi

Kursus ID 22123
Kursustype Kandidat
Semesterstart Uge 22
Semester slut Uge 25
Dage Man-fre 8:00-17:00
Pris

7.500,00 kr.

Vær opmærksom på dette kursus har deltager begrænsninger. Læs mere

0 pladser tilbage

Tilmelding